Η βασίλισσα είναι το Α και το Ω στη κυψέλη. Αυτή καθορίζει πότε και πόσο θα αναπτυχθεί στο μελίσσι. Μια καλή βασίλισσα μπορεί με τις φερομόνες της να διατηρήσει τεράστιους στρατούς μελισσών και να γεννάει ακατάπαυστα όλο το 24ωρο. Ωστόσο μέσα στα εκατομμύρια χρόνια ζωής που αριθμεί η μέλισσα στον πλανήτη έχουν αναπτυχθεί κάποια ένστικτα τα οποία είναι χαραγμένα μέσα στο dna τους. Για παράδειγμα η βασίλισσα έχει τρελή αδυναμία στις σκούρες - μαύρες κηρήθρες. Όταν λέμε μαύρες εννοούμε όχι μόνο τις "παλιές" κηρήθρες αλλά και αυτές που έχει γεννηθεί ήδη μια δύο φορές γόνος. Κατα την εκκόλαψη του γόνου οι μέλισσες απολυμαίνουν με πρόπολη. τα κουκούλια που πλέκουν οι προνύμφες μέσα στη κηρήθρα μαζί με τη πρόπολη γίνονται ένα σώμα και εκεί οφείλεται το σκούρο χρώμα της κηρήθρας.